Morro de São Paulo guarda um impressionante tesouro da natureza: são diversas espécies de vegetações como a piaçava, orquídeas, coqueiros, bromélias e trepadeiras. Destas vegetações a mais popular na ilha talvez seja a piaçava, cujo nome cientifico é Attalea funifera. Trata-se também de uma espécie de palmeira originária dos estados da Bahia, Alagoas, Espírito Santo e Sergipe. Existem lugares em Morro de São Paulo ainda intocados e com predominâncias desta espécie.
Outra vegetação típica da região são os coqueiros que se originaram no sudeste da Ásia e foram introduzidos no Brasil pelo estado da Bahia. Em Morro de São Paulo a partir da Terceira Praia há grandes áreas verdes, algumas que abrigam hotéis e pousadas, onde se vê imensas plantações de coqueiros. Na flora de Morro de São Paulo também se fazem presentes arbustos típicos da Mata Atlântica e ainda territórios de mangue. Nas regiões do mangue existe pouca diversidade de vegetação, porém, é um local com grande concentração de crustáceos, moluscos e ainda formada por arbustos e árvores de raízes suspensas.
Fontes: http://ambientes.ambientebrasil.com.br/ecoturismo/destinos/morro_de_sao_paulo_-_ba.html